RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	KLHL3	Q9UH77	587 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	TNNI2	P48788	182 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	CLC	Q05315	142 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	FAM13C	Q8NE31	585 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	SPATA32	Q96LK8	384 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	CAPN10	Q9HC96	672 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	LEFTY1	O75610	366 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	ATE1	O95260	518 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	CAP2	P40123	477 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	GJA8	P48165	433 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	MIPEP	Q99797	713 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	GINM1	Q9NU53	330 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	TGFB1	P01137	390 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	ITGB7	P26010	798 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	VPS37D	Q86XT2	251 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	PIM2	Q9P1W9	311 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MDM2-231	ENST00000544125	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	SLITRK5	O94991	958 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	GMIP	Q9P107	970 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	PPT2	Q9UMR5	302 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	PRR19	A6NJB7	356 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CYP26A1	O43174	497 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	DNAJA2	O60884	412 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	IMPDH2	P12268	514 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	GRIK1	P39086	918 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ARSH	Q5FYA8	562 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CRBN	Q96SW2	442 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	RAG1	P15918	1043 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	GBP1	P32455	592 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	SOX9	P48436	509 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CHMP4BP1	P59074	171 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CDH24	Q86UP0	819 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	RIN3	Q8TB24	985 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	RNF112	Q9ULX5	631 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	EOMES	O95936	686 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	KIF2C	Q99661	725 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	TINF2	Q9BSI4	451 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	COBL	O75128	1261 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	FOSL1	P15407	271 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CYP7A1	P22680	504 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ETV3	P41162	512 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ARID5A	Q03989	594 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	ATG4C	Q96DT6	458 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MDM2-231	ENST00000544125	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25

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