RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-210ENST00000542019 GABPAQ06546 454 aa29.94■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF280CQ8ND82 737 aa29.94■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 APPBP2Q92624 585 aa29.94■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa29.94■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa29.94■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa29.93■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 TLR2O60603 784 aa29.93■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 SP3Q02447 781 aa29.93■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa29.93■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 ADGRA2Q96PE1 1338 aa29.93■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 M0R2C6 588 aa29.92■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 ASNSP08243 561 aa29.92■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 CYP2C8P10632 490 aa29.92■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 FSD1Q9BTV5 496 aa29.92■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.92■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa29.92■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 GH2P01242 217 aa29.91■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 TREML2Q5T2D2 321 aa29.91■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.91■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.91■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 HMGCS2P54868 508 aa29.9■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 NUCB1Q02818 461 aa29.9■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 DYNLL2Q96FJ2 89 aa29.9■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 CPA4Q9UI42 421 aa29.9■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.89■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 ERO1AQ96HE7 468 aa29.89■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 WDR18Q9BV38 432 aa29.89■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.89■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 AS3MTQ9HBK9 375 aa29.89■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 TRIM17Q9Y577 477 aa29.89■■■□□ 2.38
TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L12C9JPN9 530 aa29.88■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L21D6R901 530 aa29.88■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 GPAA1O43292 621 aa29.88■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 MTMR2Q13614 643 aa29.88■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 C17orf99Q6UX52 265 aa29.88■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa29.88■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa29.87■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 GSG1L2A8MUP6 293 aa29.86■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 GUCY1A2P33402 732 aa29.86■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.86■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 C12orf60Q5U649 245 aa29.86■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 CTR9Q6PD62 1173 aa29.86■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 GINM1Q9NU53 330 aa29.86■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC85CA6NKD9 419 aa29.85■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 ABCB5Q2M3G0 1257 aa29.85■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa29.85■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.85■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 BACE1P56817 501 aa29.84■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.84■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 HPS5Q9UPZ3 1129 aa29.84■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa29.84■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 CTGFP29279 349 aa29.83■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 EVI5LQ96CN4 794 aa29.83■■■□□ 2.37
TM7SF3-210ENST00000542019 BCRP11274 1271 aa29.82■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.82■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 EFCC1Q9HA90 598 aa29.82■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L10C9JJH3 530 aa29.81■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 SEPT2Q15019 361 aa29.81■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa29.81■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 ACER1Q8TDN7 264 aa29.81■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 SWAP70Q9UH65 585 aa29.81■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 CDK8P49336 464 aa29.8■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 C16orf86Q6ZW13 317 aa29.8■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 CABP5Q9NP86 173 aa29.8■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.8■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 HTTP42858 3142 aa29.79■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 MYH8P13535 1937 aa29.79■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 AKR1B1P15121 316 aa29.79■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.79■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 OSBPL3Q9H4L5 887 aa29.79■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.79■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 C19orf81C9J6K1 198 aa29.78■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 PDE4AP27815 886 aa29.78■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 SBK1Q52WX2 424 aa29.78■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 GIMAP6Q6P9H5 292 aa29.78■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 AMOTL1Q8IY63 956 aa29.78■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.78■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 TMOD4Q9NZQ9 345 aa29.78■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 FOXP2O15409 715 aa29.77■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 GNAT2P19087 354 aa29.77■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 FEZ1Q99689 392 aa29.77■■■□□ 2.36
TM7SF3-210ENST00000542019 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms