RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0D9SFI3 127 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CXCL11O14625 94 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 SHMT1P34896 483 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CTR9Q6PD62 1173 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM227BQ96M60 508 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 SDSP20132 328 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 JAG1P78504 1218 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 SBK1Q52WX2 424 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 SWAP70Q9UH65 585 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L5A8MUK1 530 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 APPP05067 770 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 IFFO2Q5TF58 517 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 SMIM22K7EJ46 135 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D8O95759 1140 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 TDO2P48775 406 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 LAMA4Q16363 1823 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM75PA6NK02 468 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 BTBD19C9JJ37 291 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 HIP1O00291 1037 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 GH2P01242 217 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 MOGSQ13724 837 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXP2O15409 715 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 SPP2Q13103 211 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR18Q9BV38 432 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 NAPBQ9H115 298 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 CDK8P49336 464 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 CABP5Q9NP86 173 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 MYH4Q9Y623 1939 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 CRHR2Q13324 411 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 VPS53Q5VIR6 699 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-208ENST00000531226 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR25O00155 361 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 GUCY1A2P33402 732 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC17Q96LX7 622 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 ZMYM6O95789 1325 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 PDHXO00330 501 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 AKR1B1P15121 316 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 HMGCS2P54868 508 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 BACE1P56817 501 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 MTMR2Q13614 643 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 ALX1Q15699 326 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 MGAMO43451 1857 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 C19orf81C9J6K1 198 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L10C9JJH3 530 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 PPARAQ07869 468 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 SEPT2Q15019 361 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 SKAP1Q86WV1 359 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.66■■□□□ 1.22
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