RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 TATDN1Q6P1N9 297 aa29.02■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 EHD4Q9H223 541 aa29.02■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 AS3MTQ9HBK9 375 aa29.02■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ADD2P35612 726 aa29.01■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 SERPINB13Q9UIV8 391 aa29.01■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 GH2P01242 217 aa29■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 PRMT2P55345 433 aa29■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 BACE1P56817 501 aa29■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 PRKCZQ05513 592 aa29■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 ARMT1Q9H993 441 aa29■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 ATAD5Q96QE3 1844 aa28.99■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 EN2P19622 333 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 FCGRTP55899 365 aa28.99■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa28.99■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 GINM1Q9NU53 330 aa28.99■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 LOC285556D6RIA3 1793 aa28.98■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 MYPNQ86TC9 1320 aa28.98■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 PRKAB2O43741 272 aa28.98■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 SHMT1P34896 483 aa28.98■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.98■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC6Q86TZ1 520 aa28.98■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 GABRQQ9UN88 632 aa28.98■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 CYP2D6P10635 497 aa28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 GABPAQ06546 454 aa28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 NBPF11Q86T75 865 aa28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 PNMA3Q9UL41 463 aa28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 MBD4O95243 580 aa28.96■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 HOXD10P28358 340 aa28.96■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.96■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.96■■■□□ 2.23
PACSIN3-204ENST00000528201 RAET1EQ8TD07 263 aa28.95■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 EMILIN3Q9NT22 766 aa28.95■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 USP17L10C9JJH3 530 aa28.94■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SMIM22K7EJ46 135 aa28.94■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM110CQ1W6H9 321 aa28.94■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 TMOD4Q9NZQ9 345 aa28.94■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MYH1P12882 1939 aa28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 C19orf81C9J6K1 198 aa28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PEX10O60683 326 aa28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 GUCY1A2P33402 732 aa28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MTFR1Q15390 333 aa28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CRBNQ96SW2 442 aa28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 GRK4P32298 578 aa28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 UBE3CQ15386 1083 aa28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ACER1Q8TDN7 264 aa28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 FLT3LGP49771 235 aa28.91■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.91■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.91■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 DYNLL2Q96FJ2 89 aa28.9■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.89■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 USP17L2Q6R6M4 530 aa28.89■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.89■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MORF4L1Q9UBU8 362 aa28.89■■■□□ 2.22
PACSIN3-204ENST00000528201 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.89■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 SEPT2Q15019 361 aa28.88■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.88■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 ELNP15502 786 aa28.87■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 HERVK_113P62684 666 aa28.87■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 C12orf42Q96LP6 360 aa28.87■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa28.87■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 ADCY3O60266 1144 aa28.86■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.86■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 SLAIN1Q8ND83 568 aa28.86■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 FEZ1Q99689 392 aa28.86■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 IRF5Q13568 498 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 SHISA4Q96DD7 197 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 GPATCH3Q96I76 525 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 CABP5Q9NP86 173 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 RBPJLQ9UBG7 517 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 USP17L12C9JPN9 530 aa28.84■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 USP17L21D6R901 530 aa28.84■■■□□ 2.21
PACSIN3-204ENST00000528201 CCL5P13501 91 aa28.84■■■□□ 2.21
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