RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.6□□□□□ -0.87
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TRPS1-209ENST00000519674 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-209ENST00000519674 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-209ENST00000519674 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.6□□□□□ -0.87
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TRPS1-209ENST00000519674 RAB27AP51159 221 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-209ENST00000519674 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
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TRPS1-209ENST00000519674 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.57□□□□□ -0.88
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TRPS1-209ENST00000519674 GBP3Q9H0R5 595 aa9.57□□□□□ -0.88
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TRPS1-209ENST00000519674 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 BATF3Q9NR55 127 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ANO10Q9NW15 660 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 M0R2C6 588 aa9.56□□□□□ -0.88
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