RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 JAZF1Q86VZ6 243 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 C12orf40Q86WS4 652 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SVOPQ8N4V2 548 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM87BQ96K49 555 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 NACC1Q96RE7 527 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CEP41Q9BYV8 373 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 TJP2Q9UDY2 1190 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 F8W735 103 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PPM1JQ5JR12 505 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACAD11Q709F0 780 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 EEPD1Q7L9B9 569 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM178BQ8IXR5 827 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 UBASH3BQ8TF42 649 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SGSM3Q96HU1 749 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC9A7Q96T83 725 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 RRAGCQ9HB90 399 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 UPK3BL1B0FP48 263 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 C9orf172C9J069 976 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 UPK3BL2E5RIL1 263 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNAJA2O60884 412 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 LRIG2O94898 1065 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 WISP1O95388 367 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 GJB6O95452 261 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 NAT2P11245 290 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 RAG1P15918 1043 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARSHQ5FYA8 562 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PODNQ7Z5L7 613 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM260Q9NX78 707 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 NEFMP07197 916 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PPP2R5EQ16537 467 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 AKAP4Q5JQC9 854 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 FDX2Q6P4F2 183 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM13CQ8NE31 585 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 COX4I2Q96KJ9 171 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 AKTIPQ9H8T0 292 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRR13Q9NZ81 148 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 LTBP3Q9NS15 1303 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 DDAH1O94760 285 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC7A5Q01650 507 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 TTLL4Q14679 1199 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 TCEAL1Q15170 157 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 C2orf27AQ580R0 203 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 VHLLQ6RSH7 139 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 HOMER1Q86YM7 354 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 KLHL6Q8WZ60 621 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 APPBP2Q92624 585 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ISL2Q96A47 359 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNAJC7Q99615 494 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 FOXQ1Q9C009 403 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PIDD1Q9HB75 910 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PICK1Q9NRD5 415 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACTL7BQ9Y614 415 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 A0A087WZG4 1122 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms