RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515295.5

POLK-217, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLK, Length 1,438 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-217ENST00000515295 AEBP1Q8IUX7 1158 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 GLI1P08151 1106 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 USP17L7P0C7H9 530 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 MLANAQ16655 118 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 HDXQ7Z353 690 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 MFSD4AQ8N468 514 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 SPG7Q9UQ90 795 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-217ENST00000515295 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 GDNFP39905 211 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 CDK8P49336 464 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 RIN3Q8TB24 985 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 MIPEPQ99797 713 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 TSPAN15O95858 294 aa5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 FGD1P98174 961 aa5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 C1QL4Q86Z23 238 aa5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 HID1Q8IV36 788 aa5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 KIRREL1Q96J84 757 aa5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 FRMD6Q96NE9 622 aa5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 BCL11AQ9H165 835 aa5.26□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 H3BS24 57 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 GFRA2O00451 464 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 KRT1P04264 644 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 ATP2B2Q01814 1243 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 CFPP27918 469 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 KIR3DL1P43629 444 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 GRK4P32298 578 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 RAP1GAPP47736 663 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 CCDC120Q96HB5 630 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 ESR1P03372 595 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 GNA15P30679 374 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 TNK2Q07912 1038 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 UBE2FQ969M7 185 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 TOX2Q96NM4 488 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 CBX7O95931 251 aa5.22□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
POLK-217ENST00000515295 CYP7A1P22680 504 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 SEPT6Q14141 434 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 SLC6A19Q695T7 634 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 CDH24Q86UP0 819 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 DNAJB8Q8NHS0 232 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 Q96M66 194 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 AK5Q9Y6K8 562 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 C1QTNF9P0C862 333 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 LIG3P49916 1009 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-217ENST00000515295 GAB4Q2WGN9 574 aa5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms