RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 PTPAQ15257 358 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 POTEAQ6S8J7 498 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 MAP3K14Q99558 947 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 PPP6R2O75170 966 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 CAVIN2O95810 425 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L8P0C7I0 530 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 FUT2Q10981 343 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 NDUFA8P51970 172 aa26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 SP8Q8IXZ3 490 aa26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 CBX8Q9HC52 389 aa26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 A0A1B0GVL5 298 aa26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 MYH6P13533 1939 aa26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 CMA1P23946 247 aa26.42■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.42■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 JMYQ8N9B5 988 aa26.42■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.42■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 BTBD18B2RXH4 712 aa26.41■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.41■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 APBA3O96018 575 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 STX1AQ16623 288 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 TSPY2A6NKD2 308 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 AP5Z1O43299 807 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 NMT2O60551 498 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 LUZP1Q86V48 1076 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 PKN1Q16512 942 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 C6orf229H3BNL8 230 aa26.39■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF165P49910 485 aa26.39■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.39■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 SRGNP10124 158 aa26.38■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 BTDP43251 543 aa26.38■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.38■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 NPR1P16066 1061 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 PFKFB1P16118 471 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 XBP1P17861 261 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 SLF2Q8IX21 1173 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 GAKO14976 1311 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 PLCG2P16885 1265 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 SHISA4Q96DD7 197 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 SDF4Q9BRK5 362 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 TFAP4Q01664 338 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 ANKS1AQ92625 1134 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 HPSEQ9Y251 543 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 CUTAO60888 179 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF202O95125 648 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 PLCB2Q00722 1185 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 DGKHQ86XP1 1220 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 NR5A1Q13285 461 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 SHC4Q6S5L8 630 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 COA1Q9GZY4 146 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 ANO10Q9NW15 660 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 RXRBP28702 533 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 RESP18Q5W5W9 173 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 OXER1Q8TDS5 423 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 TIGD1Q96MW7 591 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.34■■□□□ 1.81
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