RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-208ENST00000511439 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.99□□□□□ -1.45
TOPBP1-208ENST00000511439 GIPC1O14908 333 aa5.99□□□□□ -1.45
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TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.99□□□□□ -1.45
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TOPBP1-208ENST00000511439 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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TOPBP1-208ENST00000511439 U3KQE9 123 aa5.93□□□□□ -1.46
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TOPBP1-208ENST00000511439 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa5.92□□□□□ -1.46
TOPBP1-208ENST00000511439 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa5.92□□□□□ -1.46
TOPBP1-208ENST00000511439 UNCXA6NJT0 531 aa5.92□□□□□ -1.46
TOPBP1-208ENST00000511439 SORBS3O60504 671 aa5.92□□□□□ -1.46
TOPBP1-208ENST00000511439 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TOPBP1-208ENST00000511439 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.92□□□□□ -1.46
TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF507Q8TCN5 953 aa5.92□□□□□ -1.46
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