RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, human

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNF8-208	ENST00000510195	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	MYH1	P12882	1939 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	APBB1	O00213	710 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	UBXN2A	P68543	259 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L10	C9JJH3	530 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	IRF5	Q13568	498 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	MTMR2	Q13614	643 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	SLC34A2	O95436	690 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	JAG1	P78504	1218 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	COA7	Q96BR5	231 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	GABRQ	Q9UN88	632 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	GDF11	O95390	407 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	PDE6A	P16499	860 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	FLT3LG	P49771	235 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	MTFR1	Q15390	333 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SNF8-208	ENST00000510195	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	GOLIM4	O00461	696 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	ADCY3	O60266	1144 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	ATP5J	P18859	108 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	GJB1	P08034	283 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	CAPN2	P17655	700 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	GCC1	Q96CN9	775 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	CCL5	P13501	91 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	GH2	P01242	217 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	GJA8	P48165	433 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	RNF208	Q9H0X6	261 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SNF8-208	ENST00000510195	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	HAUS7	Q99871	368 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	PLCD1	P51178	756 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	USP14	P54578	494 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	C12orf42	Q96LP6	360 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	32.25	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	CABP5	Q9NP86	173 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	HERVK_113	P62684	666 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	SHISA4	Q96DD7	197 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	GABPA	Q06546	454 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	ELN	P15502	786 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	SHMT1	P34896	483 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	ADD2	P35612	726 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	BCL11A	Q9H165	835 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	INHA	P05111	366 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	GJD2	Q9UKL4	321 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	UBE3C	Q15386	1083 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	LCORL	Q8N3X6	602 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	FEZ1	Q99689	392 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SNF8-208	ENST00000510195	SGPL1	O95470	568 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L15	C9J2P7	530 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L11	C9JVI0	530 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L18	D6R9N7	530 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L22	D6RA61	530 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L19	D6RCP7	530 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L20	D6RJB6	530 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L24	Q0WX57	530 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SNF8-208	ENST00000510195	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		32.18	■■■□□ 2.74

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