RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 GNAI3P08754 354 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 USP17L24Q0WX57 530 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 DEFB123Q8N688 67 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 BAG3O95817 575 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 CYBAP13498 195 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 PRDX5P30044 214 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ERVK-9P63128 1117 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ERVK-24P63145 666 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 SLFN5Q08AF3 891 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 RASIP1Q5U651 963 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 HERVK_113P62684 666 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 TREML2Q5T2D2 321 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 MYH8P13535 1937 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 RASGRF1Q13972 1273 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC174Q6PII3 467 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 C7orf61Q8IZ16 206 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 STAP2Q9UGK3 403 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 USP17L10C9JJH3 530 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 MECOMQ03112 1051 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 GPR142Q7Z601 462 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 MROH8Q9H579 483 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 PLIN1O60240 522 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 POLA2Q14181 598 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF384Q8TF68 577 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ELNP15502 786 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 CACNB3P54284 484 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 MYH7P12883 1935 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 PHKA1P46020 1223 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA5Q8NB90 893 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 LRCH3Q96II8 777 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A27O95847 323 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 XAGE2Q96GT9 111 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 KCNH6Q9H252 994 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 SWAP70Q9UH65 585 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 ATP2A1O14983 1001 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 SEPT4O43236 478 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 HLA-DOAP06340 250 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 FLT1P17948 1338 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 GABPAQ06546 454 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 SPP2Q13103 211 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1B0GUL7 405 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 SH2D4AQ9H788 454 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 JAG2Q9Y219 1238 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 RTP1P59025 263 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-210ENST00000503258 TEX11Q8IYF3 940 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms