RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLS1Q14651 629 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CLUL1Q15846 466 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CEP83Q9Y592 693 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZAP70P43403 619 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TLDC2A0PJX2 215 aa20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PFKFB1P16118 471 aa20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LPIN2Q92539 896 aa20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 USP28Q96RU2 1077 aa20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VGLL3A8MV65 326 aa20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMC6Q96SB8 1091 aa20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ERBB4Q15303 1308 aa20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.15■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TTC38Q5R3I4 469 aa20.15■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.15■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.15■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.15■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.15■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.15■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IKBKBO14920 756 aa20.14■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 APBA1Q02410 837 aa20.14■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EXOC4Q96A65 974 aa20.14■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.14■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.14■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZBTB16Q05516 673 aa20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ARHGEF10O15013 1369 aa20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 E7EWF7 191 aa20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EYA3Q99504 573 aa20.14■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRIM58Q8NG06 486 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CNBD1Q8NA66 436 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CDC23Q9UJX2 597 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TXKP42681 527 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PTH1RQ03431 593 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IL17REQ8NFR9 667 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.13■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMIM23A6NLE4 172 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MAGEA1P43355 309 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UFL1O94874 794 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EFCC1Q9HA90 598 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GBP1P32455 592 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TAOK1Q7L7X3 1001 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM212AQ96EL1 285 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC151A5D8V7 595 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PNOCQ13519 176 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.12■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MXRA7P84157 204 aa20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KCNQ3O43525 872 aa20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SP4Q02446 784 aa20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC25Q86WR0 208 aa20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SPATA5Q8NB90 893 aa20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.11■□□□□ 0.81
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DISP1Q96F81 1524 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms