RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 GINM1Q9NU53 330 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 TMOD4Q9NZQ9 345 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 C19orf81C9J6K1 198 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 PLCG2P16885 1265 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 CYP2B6P20813 491 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 PPP4CP60510 307 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 HERVK_113P62684 666 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 NUDT12Q9BQG2 462 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 DNAJC18Q9H819 358 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 BAG3O95817 575 aa28.35■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 JAG1P78504 1218 aa28.35■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 LRIT3Q3SXY7 679 aa28.35■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
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SIMC1-208ENST00000495423 DNAH12Q6ZR08 3092 aa28.34■■■□□ 2.13
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SIMC1-208ENST00000495423 GNAI2P04899 355 aa28.33■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 MAPK4P31152 587 aa28.33■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
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SIMC1-208ENST00000495423 PFASO15067 1338 aa28.33■■■□□ 2.13
SIMC1-208ENST00000495423 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 USP17L10C9JJH3 530 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 SYN1P17600 705 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 PEX10O60683 326 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 IGSF3O75054 1194 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 COL6A1P12109 1028 aa28.31■■■□□ 2.12
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SIMC1-208ENST00000495423 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 TDHQ8IZJ6 230 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 GPR108Q9NPR9 543 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 BCAR3O75815 825 aa28.3■■■□□ 2.12
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SIMC1-208ENST00000495423 ERVK-24P63145 666 aa28.3■■■□□ 2.12
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SIMC1-208ENST00000495423 DEFB123Q8N688 67 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 Q3C1V9 767 aa28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 MORN1Q5T089 497 aa28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
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SIMC1-208ENST00000495423 PALD1Q9ULE6 856 aa28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 GDF11O95390 407 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM27P14373 513 aa28.28■■■□□ 2.12
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SIMC1-208ENST00000495423 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 GPR142Q7Z601 462 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM34Q9BYJ4 488 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 PORCNQ9H237 461 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 TNNI3KQ59H18 835 aa28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 TTC39AQ5SRH9 613 aa28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 LHX8Q68G74 356 aa28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 EMILIN3Q9NT22 766 aa28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-208ENST00000495423 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.27■■■□□ 2.12
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SIMC1-208ENST00000495423 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.26■■■□□ 2.11
SIMC1-208ENST00000495423 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28.26■■■□□ 2.11
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SIMC1-208ENST00000495423 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.22■■■□□ 2.11
SIMC1-208ENST00000495423 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
SIMC1-208ENST00000495423 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa28.22■■■□□ 2.11
SIMC1-208ENST00000495423 RLFQ13129 1914 aa28.22■■■□□ 2.11
SIMC1-208ENST00000495423 LTBP2Q14767 1821 aa28.21■■■□□ 2.11
SIMC1-208ENST00000495423 MAP2K5Q13163 448 aa28.21■■■□□ 2.11
SIMC1-208ENST00000495423 TATDN1Q6P1N9 297 aa28.21■■■□□ 2.11
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