RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494984.5

QARS-223, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene QARS, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-223	ENST00000494984	SDS	P20132	328 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	FEZ1	Q99689	392 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	MYH8	P13535	1937 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	USP17L5	A8MUK1	530 aa		11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	SHMT1	P34896	483 aa		11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	TM4SF4	P48230	202 aa		11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	INHBE	P58166	350 aa		11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	CTR9	Q6PD62	1173 aa		11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.25	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	SPP2	Q13103	211 aa		11.24	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	MTMR2	Q13614	643 aa		11.24	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.24	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	VPS53	Q5VIR6	699 aa		11.24	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.24	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		11.24	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.24	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.24	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	BTBD19	C9JJ37	291 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	CDK8	P49336	464 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	HMGCS2	P54868	508 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ATP2B2	Q01814	1243 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	GABPA	Q06546	454 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PTPN18	Q99952	460 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		11.23	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PDHX	O00330	501 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	CXCL11	O14625	94 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	RAD21	O60216	631 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	AKR1B1	P15121	316 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	JAG1	P78504	1218 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PPARA	Q07869	468 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	CRHR2	Q13324	411 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	SEPT2	Q15019	361 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	SBK1	Q52WX2	424 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	GINM1	Q9NU53	330 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.22	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	USP17L10	C9JJH3	530 aa		11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PRDM1	O75626	825 aa		11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ICA1	Q05084	483 aa		11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PDE4B	Q07343	736 aa		11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.21	□□□□□ -0.61
QARS-223	ENST00000494984	PTPRF	P10586	1907 aa		11.21	□□□□□ -0.62
QARS-223	ENST00000494984	RAD50	Q92878	1312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
QARS-223	ENST00000494984	GPR25	O00155	361 aa		11.2	□□□□□ -0.62
QARS-223	ENST00000494984	CYP2C8	P10632	490 aa		11.2	□□□□□ -0.62
QARS-223	ENST00000494984	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
QARS-223	ENST00000494984	BACE1	P56817	501 aa		11.2	□□□□□ -0.62
QARS-223	ENST00000494984	HAND2	P61296	217 aa		11.2	□□□□□ -0.62
QARS-223	ENST00000494984	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62	1e-8	■■■■□ 19.9
QARS-223	ENST00000494984	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
QARS-223	ENST00000494984	TREML2	Q5T2D2	321 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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