RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 INPP5AQ14642 412 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ITGA4-211ENST00000490435 FBRSQ9HAH7 460 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA4-211ENST00000490435 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA4-211ENST00000490435 H3BS24 57 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA4-211ENST00000490435 MAPK8P45983 427 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA4-211ENST00000490435 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA4-211ENST00000490435 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA4-211ENST00000490435 C1QL4Q86Z23 238 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA4-211ENST00000490435 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGA4-211ENST00000490435 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
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ITGA4-211ENST00000490435 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.42□□□□□ -1.06
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ITGA4-211ENST00000490435 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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ITGA4-211ENST00000490435 C1QTNF9P0C862 333 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 RAC2P15153 192 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 CYP7A1P22680 504 aa8.39□□□□□ -1.07
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ITGA4-211ENST00000490435 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 UBE2FQ969M7 185 aa8.39□□□□□ -1.07
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ITGA4-211ENST00000490435 DIRC2Q96SL1 478 aa8.39□□□□□ -1.07
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ITGA4-211ENST00000490435 ATP2B2Q01814 1243 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 RIN3Q8TB24 985 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 SETDB2Q96T68 719 aa8.38□□□□□ -1.07
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ITGA4-211ENST00000490435 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
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ITGA4-211ENST00000490435 TMEM253P0C7T8 217 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 KIR3DL1P43629 444 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 SV2BQ7L1I2 683 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 C12orf49Q9H741 205 aa8.37□□□□□ -1.07
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ITGA4-211ENST00000490435 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.35□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.35□□□□□ -1.07
ITGA4-211ENST00000490435 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.35□□□□□ -1.07
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ITGA4-211ENST00000490435 CDK8P49336 464 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 ASB16Q96NS5 453 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 LMNB1P20700 586 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 CDH24Q86UP0 819 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 MYLIPQ8WY64 445 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 FRMD6Q96NE9 622 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
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ITGA4-211ENST00000490435 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 CD320Q9NPF0 282 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 ESR1P03372 595 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 MED14OSP0DP75 135 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 ETV3P41162 512 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 HK2P52789 917 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 KCNK12Q9HB15 430 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 GFRA2O00451 464 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA4-211ENST00000490435 HPXP02790 462 aa8.29□□□□□ -1.08
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