RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 FOXP2O15409 715 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 ASNSP08243 561 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 JAG1P78504 1218 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 CCL15Q16663 113 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 SBK1Q52WX2 424 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 IFNL1Q8IU54 200 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 GINM1Q9NU53 330 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 SWAP70Q9UH65 585 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.89■■□□□ 1.26
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PTPRN-216ENST00000486480 CETPP11597 493 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 TSKSQ9UJT2 592 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 CXCL11O14625 94 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 TRPA1O75762 1119 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 VPS53Q5VIR6 699 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 PTPN18Q99952 460 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 NAPBQ9H115 298 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L5A8MUK1 530 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 GH2P01242 217 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 LAMA4Q16363 1823 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 TRIM75PA6NK02 468 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 ALDH1A1P00352 501 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 CDK8P49336 464 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 LBX1P52954 281 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 SPP2Q13103 211 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 MOGSQ13724 837 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 WDR18Q9BV38 432 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.83■■□□□ 1.25
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PTPRN-216ENST00000486480 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 ALX1Q15699 326 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 CABP5Q9NP86 173 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-216ENST00000486480 ZMYM6O95789 1325 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 TBC1D8O95759 1140 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 CHMLP26374 656 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 PPARAQ07869 468 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 RAD50Q92878 1312 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 AKR1B1P15121 316 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 GUCY1A2P33402 732 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.81■■□□□ 1.24
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PTPRN-216ENST00000486480 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC17Q96LX7 622 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 IL25Q9H293 177 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 HMGCS2P54868 508 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 MTMR2Q13614 643 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 SEPT2Q15019 361 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.8■■□□□ 1.24
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PTPRN-216ENST00000486480 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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PTPRN-216ENST00000486480 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 PDHXO00330 501 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 DGKZQ13574 1117 aa22.78■■□□□ 1.24
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