RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486115.1

C7orf49-210, humanhuman

TSL 2

Gene C7orf49, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-210ENST00000486115 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.55■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 SLC10A3P09131 477 aa21.55■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 HAND2P61296 217 aa21.55■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 HTRA3P83110 453 aa21.55■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.55■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.55■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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C7orf49-210ENST00000486115 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.54■■□□□ 1.04
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C7orf49-210ENST00000486115 CAPNS2Q96L46 248 aa21.54■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.54■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 USP17L5A8MUK1 530 aa21.53■■□□□ 1.04
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C7orf49-210ENST00000486115 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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C7orf49-210ENST00000486115 PPIL2Q13356 520 aa21.53■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.53■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.53■■□□□ 1.04
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C7orf49-210ENST00000486115 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.53■■□□□ 1.04
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C7orf49-210ENST00000486115 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
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C7orf49-210ENST00000486115 RNF20Q5VTR2 975 aa21.52■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 SPRYD7Q5W111 196 aa21.52■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 TOMM22Q9NS69 142 aa21.52■■□□□ 1.04
C7orf49-210ENST00000486115 LAMA4Q16363 1823 aa21.51■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 PRDM1O75626 825 aa21.51■■□□□ 1.03
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C7orf49-210ENST00000486115 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.51■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.51■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 AKR1B1P15121 316 aa21.5■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.5■■□□□ 1.03
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C7orf49-210ENST00000486115 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.5■■□□□ 1.03
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C7orf49-210ENST00000486115 ESR2Q92731 530 aa21.49■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 KRT23Q9C075 422 aa21.49■■□□□ 1.03
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C7orf49-210ENST00000486115 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 GTF2A2P52657 109 aa21.48■■□□□ 1.03
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C7orf49-210ENST00000486115 NECTIN1Q15223 517 aa21.48■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.48■■□□□ 1.03
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C7orf49-210ENST00000486115 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.48■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.48■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 WDR18Q9BV38 432 aa21.48■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 SLC27A2O14975 620 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 MCCP23508 829 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 GJA5P36382 358 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 MAP2K2P36507 400 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 JAG1P78504 1218 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 TFAP4Q01664 338 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 ICA1Q05084 483 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 SREBF2Q12772 1141 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 SEPT2Q15019 361 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 NEDD4P46934 1319 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 MYH8P13535 1937 aa21.47■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.46■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 IRF6O14896 467 aa21.46■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.46■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 SH2D4AQ9H788 454 aa21.46■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.46■■□□□ 1.03
C7orf49-210ENST00000486115 TRIM75PA6NK02 468 aa21.45■■□□□ 1.02
C7orf49-210ENST00000486115 CETPP11597 493 aa21.45■■□□□ 1.02
C7orf49-210ENST00000486115 GUCY1A2P33402 732 aa21.45■■□□□ 1.02
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