RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484886.1

SNX17-206, Transcript of sorting nexin 17, humanhuman

TSL 2

Gene SNX17, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17-206ENST00000484886 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX17-206ENST00000484886 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX17-206ENST00000484886 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 USP17L12C9JPN9 530 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 USP17L21D6R901 530 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 PDHXO00330 501 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 GH2P01242 217 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 GNAT2P19087 354 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 EVX2Q03828 476 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 GINM1Q9NU53 330 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 JAG1P78504 1218 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 DGKZQ13574 1117 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 CABP5Q9NP86 173 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 SHMT1P34896 483 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 TDO2P48775 406 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 SWAP70Q9UH65 585 aa22.93■■□□□ 1.26
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SNX17-206ENST00000484886 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 HMGCS2P54868 508 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 MOGSQ13724 837 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 C12orf60Q5U649 245 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 CTR9Q6PD62 1173 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 MYH8P13535 1937 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 GABPAQ06546 454 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 MTMR2Q13614 643 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 FEZ1Q99689 392 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 WDR18Q9BV38 432 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX17-206ENST00000484886 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 TLR2O60603 784 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 NEFLP07196 543 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 SP3Q02447 781 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 ERO1AQ96HE7 468 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 USP17L10C9JJH3 530 aa22.88■■□□□ 1.25
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SNX17-206ENST00000484886 PDE4AP27815 886 aa22.88■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 CDK8P49336 464 aa22.88■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 BACE1P56817 501 aa22.88■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.88■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.88■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.88■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 CYP2C8P10632 490 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 TREML2Q5T2D2 321 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 FAM227BQ96M60 508 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 NAPBQ9H115 298 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 CPA4Q9UI42 421 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 A0A0D9SFI3 127 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 C19orf81C9J6K1 198 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 CAPN15O75808 1086 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 SEPT2Q15019 361 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 SBK1Q52WX2 424 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 TICAM2Q86XR7 235 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 PNMA3Q9UL41 463 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 KIF22Q14807 665 aa22.85■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.85■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.85■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.85■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.85■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.85■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 AKR1B1P15121 316 aa22.84■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 SDSP20132 328 aa22.84■■□□□ 1.25
SNX17-206ENST00000484886 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.84■■□□□ 1.25
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