RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481849.5

HLA-B-253, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

Gene HLA-B, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-253	ENST00000481849	LPIN2	Q92539	896 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CSAD	Q9Y600	493 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	MAST3	O60307	1309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PRR20E	P86478	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PRR20C	P86479	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PRR20D	P86480	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PRR20B	P86481	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PRR20A	P86496	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	TCP10	Q12799	353 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CCL15	Q16663	113 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	MEIS3	Q99687	375 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	TNFRSF10A	O00220	468 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	DGAT1	O75907	488 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PRDX5	P30044	214 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	ADORA1	P30542	326 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	GTF2A2	P52657	109 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CIAO1	O76071	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PHKA1	P46020	1223 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CAP1	Q01518	475 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	SP3	Q02447	781 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849		H0YGN5	161 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	NFIA	Q12857	509 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CCER2	I3L3R5	266 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	IRF6	O14896	467 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	CETP	P11597	493 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	INPP5B	P32019	993 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	TIMM10	P62072	90 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	ERO1B	Q86YB8	467 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HLA-B-253	ENST00000481849	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	BTBD19	C9JJ37	291 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	GDF9	O60383	454 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	TFCP2	Q12800	502 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	FOXC1	Q12948	553 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	COL26A1	Q96A83	441 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	THAP11	Q96EK4	314 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	BCAR3	O75815	825 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HLA-B-253	ENST00000481849	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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