RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480476.1

NIN-211, Transcript of ninein, humanhuman

TSL 3

Gene NIN, Length 920 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIN-211ENST00000480476 FUT4P22083 530 aa5.9□□□□□ -1.46
NIN-211ENST00000480476 FAAP100Q0VG06 881 aa5.9□□□□□ -1.46
NIN-211ENST00000480476 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
NIN-211ENST00000480476 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.9□□□□□ -1.46
NIN-211ENST00000480476 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.9□□□□□ -1.46
NIN-211ENST00000480476 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.9□□□□□ -1.46
NIN-211ENST00000480476 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.9□□□□□ -1.46
NIN-211ENST00000480476 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
NIN-211ENST00000480476 PIDD1Q9HB75 910 aa5.9□□□□□ -1.46
NIN-211ENST00000480476 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.9□□□□□ -1.46
NIN-211ENST00000480476 GRIN2AQ12879 1464 aa5.9□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 FCGRTP55899 365 aa5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 ID3Q02535 119 aa5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 PI16Q6UXB8 463 aa5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 LGR6Q9HBX8 967 aa5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.89□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 GIPC1O14908 333 aa5.88□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 CTSWP56202 376 aa5.88□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 SPRED2Q7Z698 418 aa5.88□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.88□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 BCO2Q9BYV7 579 aa5.88□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 C12orf49Q9H741 205 aa5.88□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 ZNF862O60290 1169 aa5.87□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 KCNB2Q92953 911 aa5.87□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.87□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 DISC1Q9NRI5 854 aa5.87□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 ADAMTS12P58397 1594 aa5.87□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 CTSHP09668 335 aa5.86□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.86□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 CRELD1Q96HD1 420 aa5.86□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.86□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.86□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 NUP160Q12769 1436 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 INHBBP09529 407 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 FAM87AP0C7U9 286 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 ARNTP27540 789 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 FANCCQ00597 558 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 CDK5R2Q13319 367 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 TTLL4Q14679 1199 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 PDZD3Q86UT5 571 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 SULF2Q8IWU5 870 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 RNF34Q969K3 372 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 AKAP2Q9Y2D5 859 aa5.85□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 IQGAP2Q13576 1575 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 PTPRGP23470 1445 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 MTUS2Q5JR59 1369 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 PLEKHD1A6NEE1 506 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 NME2P22392 152 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 ZNF76P36508 570 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 ZSWIM9Q86XI8 627 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 NETO1Q8TDF5 533 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.84□□□□□ -1.47
NIN-211ENST00000480476 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 IGSF3O75054 1194 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 USP17L7P0C7H9 530 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 MLANAQ16655 118 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 PI4K2BQ8TCG2 481 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 C8orf37Q96NL8 207 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.83□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.82□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 PBRM1Q86U86 1689 aa5.82□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 ERVK-24P63145 666 aa5.82□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.82□□□□□ -1.48
NIN-211ENST00000480476 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms