RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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SHQ1-206ENST00000471526 USP5P45974 858 aa23.48■■□□□ 1.35
SHQ1-206ENST00000471526 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.48■■□□□ 1.35
SHQ1-206ENST00000471526 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.48■■□□□ 1.35
SHQ1-206ENST00000471526 DEFB118Q96PH6 123 aa23.48■■□□□ 1.35
SHQ1-206ENST00000471526 PTPRFP10586 1907 aa23.48■■□□□ 1.35
SHQ1-206ENST00000471526 C19orf81C9J6K1 198 aa23.47■■□□□ 1.35
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L10C9JJH3 530 aa23.47■■□□□ 1.35
SHQ1-206ENST00000471526 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SHQ1-206ENST00000471526 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.47■■□□□ 1.35
SHQ1-206ENST00000471526 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.47■■□□□ 1.35
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SHQ1-206ENST00000471526 GINM1Q9NU53 330 aa23.46■■□□□ 1.35
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SHQ1-206ENST00000471526 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.45■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 PEX10O60683 326 aa23.45■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 CERS3Q8IU89 383 aa23.45■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.45■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 GJD2Q9UKL4 321 aa23.45■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 GH2P01242 217 aa23.44■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.44■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 BCL11AQ9H165 835 aa23.44■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 APBB1O00213 710 aa23.43■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 HERVK_113P62684 666 aa23.43■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.43■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.43■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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SHQ1-206ENST00000471526 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.42■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.42■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.42■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 SIPA1L1O43166 1804 aa23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 HMGCRP04035 888 aa23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 MS4A1P11836 297 aa23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 TRIM32Q13049 653 aa23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 TTC6Q86TZ1 520 aa23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.4■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 CYP2B6P20813 491 aa23.4■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.4■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.4■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 FEZ1Q99689 392 aa23.4■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.4■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.4■■□□□ 1.34
SHQ1-206ENST00000471526 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.39■■□□□ 1.33
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SHQ1-206ENST00000471526 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 Q3C1V9 767 aa23.39■■□□□ 1.33
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SHQ1-206ENST00000471526 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.39■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 EHD4Q9H223 541 aa23.39■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 COG6Q9Y2V7 657 aa23.39■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 EVI5O60447 810 aa23.38■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 PLCD1P51178 756 aa23.38■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.38■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.38■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 RPTORQ8N122 1335 aa23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 MAPK4P31152 587 aa23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 ERVK-9P63128 1117 aa23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 ERVK-24P63145 666 aa23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 TRIB2Q92519 343 aa23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 CABP5Q9NP86 173 aa23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 GOLIM4O00461 696 aa23.36■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 HMMRO75330 724 aa23.36■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 PDE6AP16499 860 aa23.36■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 PDE3AQ14432 1141 aa23.36■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.36■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 PORCNQ9H237 461 aa23.36■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.36■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L15C9J2P7 530 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L11C9JVI0 530 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L18D6R9N7 530 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L22D6RA61 530 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.35■■□□□ 1.33
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