RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 DNAI1Q9UI46 699 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 TRDNQ13061 729 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 HOMER1Q86YM7 354 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 GOLGA5Q8TBA6 731 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 TOMM22Q9NS69 142 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 H3BQV1 296 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 IFFO2Q5TF58 517 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa15.93■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 EVX2Q03828 476 aa15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 CTR9Q6PD62 1173 aa15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 A0A1B0GUL6 1792 aa15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 SRLQ86TD4 932 aa15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 RCOR1Q9UKL0 485 aa15.92■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 MECOMQ03112 1051 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 MSL1Q68DK7 614 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 TMC6Q7Z403 805 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ENGASEQ8NFI3 743 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 EXOC4Q96A65 974 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ZBTB9Q96C00 473 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 MYL10Q9BUA6 226 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 NRDCO43847 1150 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 FBXW7Q969H0 707 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 CARD6Q9BX69 1037 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.91■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 DOCK2Q92608 1830 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 CCP110O43303 1012 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 KINO60870 393 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 GPSM2P81274 684 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 URI1O94763 535 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 GRIK5Q16478 980 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 OLFM4Q6UX06 510 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 IQUBQ8NA54 791 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 ADAM21Q9UKJ8 722 aa15.9■□□□□ 0.14
GPC1-208ENST00000469694 FANCGO15287 622 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 GYS2P54840 703 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 EVCP57679 992 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 IFNKQ9P0W0 207 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 ALX1Q15699 326 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 CRY2Q49AN0 593 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 EPC1Q9H2F5 836 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 SMC2O95347 1197 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 MICU3Q86XE3 530 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 TMX1Q9H3N1 280 aa15.89■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 RXRBP28702 533 aa15.88■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 ICE2Q659A1 982 aa15.88■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 PRDM1O75626 825 aa15.88■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 UFL1O94874 794 aa15.88■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.88■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.88■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 FUT8Q9BYC5 575 aa15.88■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15.88■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
GPC1-208ENST00000469694 ACTN2P35609 894 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms