RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 LILRB2Q8N423 598 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 PPME1Q9Y570 386 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ABCA6Q8N139 1617 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 PLXNC1O60486 1568 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 GFRA2O00451 464 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 PDPK1O15530 556 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ALAS2P22557 587 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 PIP4K2BP78356 416 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 FXNQ16595 210 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 REREQ9P2R6 1566 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ATP10AO60312 1499 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ROCK1Q13464 1354 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 LINC01387J3KSC0 135 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 CYP11A1P05108 521 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ARL4DP49703 201 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 CHMP4BP1P59074 171 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 RASGRF1Q13972 1273 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 INPP5AQ14642 412 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 PPP2R5EQ16537 467 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 WNT8BQ93098 351 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 GPATCH3Q96I76 525 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 CORO1BQ9BR76 489 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 NCOA1Q15788 1441 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 KIF15Q9NS87 1388 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 HTR3BO95264 441 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 MAOBP27338 520 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 POU4F3Q15319 338 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 KRT82Q9NSB4 513 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 A2MP01023 1474 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 A0A1W2PQH9 124 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 FSCN2O14926 492 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 GJB6O95452 261 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ALBP02768 609 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 CTSBP07858 339 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 TTC6Q86TZ1 520 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 TM9SF2Q99805 663 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 AGLP35573 1532 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 B2RBV5 119 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF862O60290 1169 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 EPXP11678 715 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 PTPROQ16827 1216 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 FANCLQ9NW38 375 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ERBINQ96RT1 1412 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF4B-204ENST00000466185 ESYT3A0FGR9 886 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 HFM1A2PYH4 1435 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 CDC45O75419 566 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 DDAH1O94760 285 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 GUCY2CP25092 1073 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 HDXQ7Z353 690 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 TM4SF5O14894 197 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 LILRB5O75023 590 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 PDE3AQ14432 1141 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 MTERF2Q49AM1 385 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF4B-204ENST00000466185 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms