RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SUSD4Q5VX71 490 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 RESP18Q5W5W9 173 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 VPS37DQ86XT2 251 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CLIC4Q9Y696 253 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GVL5 298 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 B4E1Z4 1266 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CTIFO43310 598 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 MBD4O95243 580 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PFKFB1P16118 471 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TDO2P48775 406 aa9.79□□□□□ -0.84
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ACTB-208ENST00000464611 SEMA3FQ13275 785 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 RASGRF1Q13972 1273 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 RTN1Q16799 776 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SMIM5Q71RC9 77 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CERS3Q8IU89 383 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SETDB2Q96T68 719 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NYXQ9GZU5 481 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TRPC6Q9Y210 931 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NPHP1O15259 732 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NTSR2O95665 410 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 MMP1P03956 469 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 FGRP09769 529 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 SKILP12757 684 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 TNNT1P13805 278 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PTPAQ15257 358 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PTPN14Q15678 1187 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 IQCA1Q86XH1 822 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 MLKLQ8NB16 471 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 FANCBQ8NB91 859 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 MAP3K14Q99558 947 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 NBPF3Q9H094 633 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-208ENST00000464611 A0A0G2JLW4 131 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 PTPREP23469 700 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 MYL5Q02045 173 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CHRNDQ07001 517 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 PPARAQ07869 468 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 NFIXQ14938 502 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 PI16Q6UXB8 463 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 KRBA2Q6ZNG9 492 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SYNE4Q8N205 404 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 KIF18AQ8NI77 898 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 FERMT2Q96AC1 680 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 FEZ1Q99689 392 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 DDAH1O94760 285 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SMC2O95347 1197 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB7AO95365 584 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 MMP10P09238 476 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CYP7A1P22680 504 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
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