RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.19■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 DOCK1Q14185 1865 aa25.19■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 TREML2Q5T2D2 321 aa25.18■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 PLCD1P51178 756 aa25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 JAG1P78504 1218 aa25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 BCL11AQ9H165 835 aa25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 GDF11O95390 407 aa25.16■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 CTGFP29279 349 aa25.16■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 LCORLQ8N3X6 602 aa25.16■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 CABP5Q9NP86 173 aa25.16■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 GH2P01242 217 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 MTMR2Q13614 643 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 SWAP70Q9UH65 585 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 SHMT1P34896 483 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 C12orf42Q96LP6 360 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 ARMT1Q9H993 441 aa25.14■■□□□ 1.62
SIKE1-204ENST00000462123 ERC2O15083 957 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 MBD4O95243 580 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 USP14P54578 494 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 MYPNQ86TC9 1320 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 HTTP42858 3142 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 RAET1EQ8TD07 263 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 FOCADQ5VW36 1801 aa25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 IRF5Q13568 498 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 GCC1Q96CN9 775 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 SIPA1L1O43166 1804 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 GRK4P32298 578 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 COA7Q96BR5 231 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 CRBNQ96SW2 442 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 PRKCZQ05513 592 aa25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 C12orf60Q5U649 245 aa25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 PXYLP1Q8TE99 480 aa25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC17Q96LX7 622 aa25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 POTEFA5A3E0 1075 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 CAPN2P17655 700 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 APPBP2Q92624 585 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-204ENST00000462123 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 PRKAB2O43741 272 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 HERVK_113P62684 666 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 FEZ1Q99689 392 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L15C9J2P7 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L12C9JPN9 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L11C9JVI0 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L21D6R901 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L18D6R9N7 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L22D6RA61 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L19D6RCP7 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L20D6RJB6 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 GNAT2P19087 354 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 GUCY1A2P33402 732 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 FLT3LGP49771 235 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 UBXN2AP68543 259 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 USP17L24Q0WX57 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.05■■□□□ 1.6
SIKE1-204ENST00000462123 SBK1Q52WX2 424 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms