RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.61■■□□□ 1.53
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SCAF8-204ENST00000461219 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 APPP05067 770 aa24.6■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 PLCD1P51178 756 aa24.6■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 SP3Q02447 781 aa24.6■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 NUCB1Q02818 461 aa24.6■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 EVI5LQ96CN4 794 aa24.6■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 STAP2Q9UGK3 403 aa24.6■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.6■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.6■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 KIF22Q14807 665 aa24.59■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGEF6Q15052 776 aa24.59■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.59■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.59■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.58■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 GH2P01242 217 aa24.58■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 GNAT2P19087 354 aa24.58■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.58■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 ABHD8Q96I13 439 aa24.58■■□□□ 1.53
SCAF8-204ENST00000461219 GPAA1O43292 621 aa24.57■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 TLR2O60603 784 aa24.57■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 CYP2D6P10635 497 aa24.57■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 HMGCS2P54868 508 aa24.57■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
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SCAF8-204ENST00000461219 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.57■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.57■■□□□ 1.52
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SCAF8-204ENST00000461219 RILPL2Q969X0 211 aa24.57■■□□□ 1.52
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SCAF8-204ENST00000461219 FEZ1Q99689 392 aa24.57■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 SWAP70Q9UH65 585 aa24.57■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 PNMA3Q9UL41 463 aa24.57■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 USP17L12C9JPN9 530 aa24.56■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 USP17L21D6R901 530 aa24.56■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 TDO2P48775 406 aa24.56■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 MTMR2Q13614 643 aa24.56■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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SCAF8-204ENST00000461219 M0R2C6 588 aa24.55■■□□□ 1.52
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SCAF8-204ENST00000461219 WDR18Q9BV38 432 aa24.55■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.55■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.55■■□□□ 1.52
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SCAF8-204ENST00000461219 USP17L10C9JJH3 530 aa24.54■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 SHMT1P34896 483 aa24.54■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 MOGSQ13724 837 aa24.54■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.54■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.54■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 CPA4Q9UI42 421 aa24.54■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.54■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.54■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.53■■□□□ 1.52
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SCAF8-204ENST00000461219 C19orf81C9J6K1 198 aa24.53■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 CYP2C8P10632 490 aa24.53■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 OSBPP22059 807 aa24.53■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 BACE1P56817 501 aa24.53■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 C12orf60Q5U649 245 aa24.53■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 EFCC1Q9HA90 598 aa24.53■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 MGAMO43451 1857 aa24.53■■□□□ 1.52
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SCAF8-204ENST00000461219 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.52■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.52■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 CTR9Q6PD62 1173 aa24.52■■□□□ 1.52
SCAF8-204ENST00000461219 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.52■■□□□ 1.52
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SCAF8-204ENST00000461219 GABPAQ06546 454 aa24.51■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
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SCAF8-204ENST00000461219 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.51■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.5■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
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SCAF8-204ENST00000461219 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.5■■□□□ 1.51
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SCAF8-204ENST00000461219 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.5■■□□□ 1.51
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SCAF8-204ENST00000461219 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.49■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.49■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.49■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.49■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.49■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 SEPT2Q15019 361 aa24.48■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 C17orf99Q6UX52 265 aa24.48■■□□□ 1.51
SCAF8-204ENST00000461219 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.48■■□□□ 1.51
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