RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 AS3MTQ9HBK9 375 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 GINM1Q9NU53 330 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 HMGCS2P54868 508 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF6Q15052 776 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 BCRP11274 1271 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 SOX10P56693 466 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 EVX2Q03828 476 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 KIF22Q14807 665 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 SH3D19Q5HYK7 790 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXB3-202ENST00000460160 MGAMO43451 1857 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 PRKAB2O43741 272 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 CTGFP29279 349 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 GH2P01242 217 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 SHMT1P34896 483 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 BACE1P56817 501 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 GABPAQ06546 454 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 MTMR2Q13614 643 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 AAMPQ13685 434 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 MYH8P13535 1937 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM47Q96LD4 638 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 GNRH1P01148 92 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 CYP2D6P10635 497 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 PSMC4P43686 418 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 GCC1Q96CN9 775 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 PNMA3Q9UL41 463 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 USP17L10C9JJH3 530 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 ERC2O15083 957 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 MX1P20591 662 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXB3-202ENST00000460160 C19orf81C9J6K1 198 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 ARMC5Q96C12 935 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 TMOD4Q9NZQ9 345 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 OSBP2Q969R2 916 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
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HOXB3-202ENST00000460160 APPBP2Q92624 585 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 SRRDQ9UH36 339 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 SMIM22K7EJ46 135 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 OSBPP22059 807 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 GUCY1A2P33402 732 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 PRMT2P55345 433 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 DYNLL2Q96FJ2 89 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 CABP5Q9NP86 173 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 EMILIN3Q9NT22 766 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 USP17L12C9JPN9 530 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 USP17L21D6R901 530 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 C12orf60Q5U649 245 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 FCGRTP55899 365 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 FAM110CQ1W6H9 321 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 USP17L2Q6R6M4 530 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 ACER1Q8TDN7 264 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 SWAP70Q9UH65 585 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 HOXD10P28358 340 aa28.45■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF333Q96JL9 665 aa28.45■■■□□ 2.15
HOXB3-202ENST00000460160 SEPT2Q15019 361 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-202ENST00000460160 CTR9Q6PD62 1173 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-202ENST00000460160 FEZ1Q99689 392 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-202ENST00000460160 STAP2Q9UGK3 403 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-202ENST00000460160 MYPNQ86TC9 1320 aa28.44■■■□□ 2.14
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