RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.36■□□□□ 0.53
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SHQ1-202ENST00000444040 TMX1Q9H3N1 280 aa18.33■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 INTS13Q9NVM9 706 aa18.33■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 NARFQ9UHQ1 456 aa18.33■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM75PA6NK02 468 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 ORC4O43929 436 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 PTF1AQ7RTS3 328 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 PDILTQ8N807 584 aa18.32■□□□□ 0.52
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