RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L21D6R901 530 aa30.03■■■□□ 2.4
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HTATSF1-202ENST00000425695 GPAA1O43292 621 aa30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 DGKZQ13574 1117 aa30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 TATDN1Q6P1N9 297 aa30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
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HTATSF1-202ENST00000425695 C12orf60Q5U649 245 aa30■■■□□ 2.39
HTATSF1-202ENST00000425695 CTR9Q6PD62 1173 aa30■■■□□ 2.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa29.96■■■□□ 2.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 FAM227BQ96M60 508 aa29.93■■■□□ 2.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.92■■■□□ 2.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM17Q9Y577 477 aa29.9■■■□□ 2.38
HTATSF1-202ENST00000425695 C19orf81C9J6K1 198 aa29.89■■■□□ 2.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa29.89■■■□□ 2.38
HTATSF1-202ENST00000425695 SDSP20132 328 aa29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 TAOK2Q9UL54 1235 aa29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRA2Q96PE1 1338 aa29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L2Q6R6M4 530 aa29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 NAPBQ9H115 298 aa29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.86■■■□□ 2.37
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