RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409972.5

RBMS1-205, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-205ENST00000409972 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RBMS1-205ENST00000409972 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.45■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 RASSF7Q02833 373 aa25.45■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.45■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 CPLX1O14810 134 aa25.44■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 GABPAQ06546 454 aa25.44■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.44■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.44■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 IDI2Q9BXS1 227 aa25.44■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.43■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 TTC6Q86TZ1 520 aa25.43■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 UTRNP46939 3433 aa25.43■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 MYH8P13535 1937 aa25.43■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 SIPA1L1O43166 1804 aa25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 NT5C2P49902 561 aa25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 FOSBP53539 338 aa25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 RCAN1P53805 252 aa25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 TCP10Q12799 353 aa25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 FERMT3Q86UX7 667 aa25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 FANCBQ8NB91 859 aa25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 JDP2Q8WYK2 163 aa25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 PHKBQ93100 1093 aa25.42■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 TSPY3P0CV98 308 aa25.41■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 TSPY8P0CW00 308 aa25.41■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 SLURP2P0DP57 97 aa25.41■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 TROAPQ12815 778 aa25.41■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 RTN1Q16799 776 aa25.41■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.41■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.41■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.41■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.4■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.4■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.4■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 SPDYE6P0CI01 402 aa25.4■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 ANKS1AQ92625 1134 aa25.4■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.4■■□□□ 1.66
RBMS1-205ENST00000409972 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.39■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 DGKHQ86XP1 1220 aa25.39■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 KIF3AQ9Y496 699 aa25.39■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.38■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 H3BQV1 296 aa25.38■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 IFNAR1P17181 557 aa25.38■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 IFFO2Q5TF58 517 aa25.38■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.38■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.38■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.38■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 TRAK2O60296 914 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CDKL5O76039 1030 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 GUCY1B3Q02153 619 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 NBPF11Q86T75 865 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 OGFOD1Q8N543 542 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 AIFM3Q96NN9 605 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 SHTN1A0MZ66 631 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 RESTQ13127 1097 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.37■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 MYH6P13533 1939 aa25.36■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 DDAH1O94760 285 aa25.36■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 SHMT1P34896 483 aa25.36■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 DLGAP5Q15398 846 aa25.36■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.36■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 HLA-DOAP06340 250 aa25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 EHD4Q9H223 541 aa25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 DNAJC18Q9H819 358 aa25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 SWAP70Q9UH65 585 aa25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.35■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CLRN2A0PK11 232 aa25.34■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 FZD9O00144 591 aa25.34■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CALM1P0DP23 149 aa25.34■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CALM2P0DP24 149 aa25.34■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 CALM3P0DP25 149 aa25.34■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 AKR1B1P15121 316 aa25.34■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 GUCY1A2P33402 732 aa25.34■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
RBMS1-205ENST00000409972 FUT2Q10981 343 aa25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms