RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 IQCA1Q86XH1 822 aa23.64■■□□□ 1.37
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ODC1-202ENST00000405333 VEZTQ9HBM0 779 aa23.64■■□□□ 1.37
ODC1-202ENST00000405333 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.64■■□□□ 1.37
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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ODC1-202ENST00000405333 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.63■■□□□ 1.37
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ODC1-202ENST00000405333 MTA3Q9BTC8 594 aa23.61■■□□□ 1.37
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ODC1-202ENST00000405333 STX8Q9UNK0 236 aa23.55■■□□□ 1.36
ODC1-202ENST00000405333 TROAPQ12815 778 aa23.55■■□□□ 1.36
ODC1-202ENST00000405333 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.55■■□□□ 1.36
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ODC1-202ENST00000405333 DGKHQ86XP1 1220 aa23.53■■□□□ 1.36
ODC1-202ENST00000405333 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.53■■□□□ 1.36
ODC1-202ENST00000405333 HACL1Q9UJ83 578 aa23.53■■□□□ 1.36
ODC1-202ENST00000405333 NID2Q14112 1375 aa23.53■■□□□ 1.36
ODC1-202ENST00000405333 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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