RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 GDF11O95390 407 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3-201ENST00000392415 RGS19P49795 217 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3-201ENST00000392415 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3-201ENST00000392415 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3-201ENST00000392415 GCC1Q96CN9 775 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3-201ENST00000392415 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF22Q14807 665 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.84■■□□□ 1.57
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UBE2E3-201ENST00000392415 HMGCS2P54868 508 aa24.83■■□□□ 1.56
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UBE2E3-201ENST00000392415 TREML2Q5T2D2 321 aa24.83■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.83■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
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UBE2E3-201ENST00000392415 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 ERC2O15083 957 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKAB2O43741 272 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 BACE1P56817 501 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 GNRH1P01148 92 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 SHMT1P34896 483 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 C19orf81C9J6K1 198 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L10C9JJH3 530 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 GH2P01242 217 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 MX1P20591 662 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 MTMR2Q13614 643 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 CTGFP29279 349 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 EVX2Q03828 476 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.561e-6■■■■□ 22.5
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UBE2E3-201ENST00000392415 PNMA3Q9UL41 463 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 BRCA2P51587 3418 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP2D6P10635 497 aa24.77■■□□□ 1.56
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UBE2E3-201ENST00000392415 SOX10P56693 466 aa24.77■■□□□ 1.56
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UBE2E3-201ENST00000392415 OSBP2Q969R2 916 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM47Q96LD4 638 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 CABP5Q9NP86 173 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2E3-201ENST00000392415 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.77■■□□□ 1.56
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UBE2E3-201ENST00000392415 PRMT2P55345 433 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 C12orf60Q5U649 245 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SWAP70Q9UH65 585 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L12C9JPN9 530 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L21D6R901 530 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 OSBPP22059 807 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SMC5Q8IY18 1101 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ARMC5Q96C12 935 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 STAP2Q9UGK3 403 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 MYH8P13535 1937 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SRRDQ9UH36 339 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXD10P28358 340 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 GUCY1A2P33402 732 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE1AP54750 535 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 FCGRTP55899 365 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CTR9Q6PD62 1173 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 C12orf42Q96LP6 360 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SMIM22K7EJ46 135 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 GPAA1O43292 621 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SEPT2Q15019 361 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.71■■□□□ 1.55
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