RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376350.7

PTPRH-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,877 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-202ENST00000376350 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 UIMC1Q96RL1 719 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 SDF4Q9BRK5 362 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 CTR9Q6PD62 1173 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 NLRP5P59047 1200 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 CBX1P83916 185 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF654Q8IZM8 581 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 KINO60870 393 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 FEZ1Q99689 392 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 TMC4Q7Z404 712 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 SUPT20HQ8NEM7 779 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 MAP7D2Q96T17 732 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRH-202ENST00000376350 GDF11O95390 407 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 PLCD1P51178 756 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TMEM87BQ96K49 555 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 CFAP45Q9UL16 551 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 CRKP46108 304 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 GPR162Q16538 588 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 APOA5Q6Q788 366 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 BRMS1Q9HCU9 246 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 PKNOX2Q96KN3 472 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TERF1P54274 439 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 ISM2Q6H9L7 571 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 MYRIPQ8NFW9 859 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 PODNQ7Z5L7 613 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 CFAP100Q494V2 611 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 PGBD1Q96JS3 809 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 CABP5Q9NP86 173 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 UBE2Q2LH0YL09 131 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 BIN1O00499 593 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 CRY2Q49AN0 593 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 SOGA3Q5TF21 947 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TMTC2Q8N394 836 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 FSIP1Q8NA03 581 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 ANTXR2P58335 489 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 PDILTQ8N807 584 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 NUP98P52948 1817 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 BTAF1O14981 1849 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 PFKFB2O60825 505 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 NFIAQ12857 509 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 FANCBQ8NB91 859 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 PNMA1Q8ND90 353 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 RTKN2Q8IZC4 609 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 CSRNP1Q96S65 589 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 CLSTN2Q9H4D0 955 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 KIF5BP33176 963 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TPM3P06753 285 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 IL17RAQ96F46 866 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TAF1P21675 1872 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 TNNT1P13805 278 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 RASSF7Q02833 373 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
PTPRH-202ENST00000376350 USP28Q96RU2 1077 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms