RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 RASA3Q14644 834 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC17Q96LX7 622 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TNKSO95271 1327 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 CNTNAP1P78357 1384 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 RASA1P20936 1047 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SLC4A3P48751 1232 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 GABPAQ06546 454 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 APOBRQ0VD83 1088 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 FBXL16Q8N461 479 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TMX3Q96JJ7 454 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 LIFRP42702 1097 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 STK3Q13188 491 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 DCAF15Q66K64 600 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SULF1Q8IWU6 871 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 CABP5Q9NP86 173 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.28□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.28□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 KAT14Q9H8E8 782 aa14.28□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.28□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.28□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.28□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.28□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.27□□□□□ -0.12
PTPRK-201ENST00000368202 FAM196BA6NMK8 535 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 TBC1D12O60347 775 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 SHMT1P34896 483 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 DGKHQ86XP1 1220 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 LY9Q9HBG7 655 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 STX8Q9UNK0 236 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 MYH4Q9Y623 1939 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ZBTB43O43298 467 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CALM1P0DP23 149 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CALM2P0DP24 149 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CALM3P0DP25 149 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 AKR1B1P15121 316 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 NF2P35240 595 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ME3Q16798 604 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CPLX1O14810 134 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 NMT2O60551 498 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CUL4AQ13619 759 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 SEC23AQ15436 765 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 APOA5Q6Q788 366 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 DNAJC18Q9H819 358 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 PFKFB2O60825 505 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 GDF11O95390 407 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 LARGE1O95461 756 aa14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms