RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L12C9JPN9 530 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L21D6R901 530 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 STRN3Q13033 797 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC14Q49A88 953 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC121Q6ZUS5 278 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 KCNQ3O43525 872 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 BEND3Q5T5X7 828 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 SLC8A3P57103 927 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CABP7Q86V35 215 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 NOX5Q96PH1 765 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ADALQ6DHV7 355 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH1B1P30837 517 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEA1P43355 309 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf74Q6P047 294 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 PLXNC1O60486 1568 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 DYMQ7RTS9 669 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CPXCR1Q8N123 301 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0D9SFI3 127 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ZBED4O75132 1171 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 TRPC3Q13507 836 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 NDC80O14777 642 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 LIN9Q5TKA1 542 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 LTKP29376 864 aa22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 NSMFQ6X4W1 530 aa22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 PDE6AP16499 860 aa22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 CFBP00751 764 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 HAUS7Q99871 368 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC3O60645 756 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 TCP10Q12799 353 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 MSL1Q68DK7 614 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 OGFRQ9NZT2 677 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 DLGAP5Q15398 846 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 MYCT1Q8N699 235 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 NELFBQ8WX92 580 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 FLOT1O75955 427 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 TERF1P54274 439 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 IQCDQ96DY2 449 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 PTH1RQ03431 593 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 TAF12Q16514 161 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF365Q70YC5 407 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 TTC16Q8NEE8 873 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 COPRSQ9NQ92 184 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.23e-6■■■□□ 15.8
CCSAP-203ENST00000366687 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 SMCO2A6NFE2 343 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH3A1P30838 453 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 TEKT1Q969V4 418 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 DTNBO60941 627 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 USH1GQ495M9 461 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 PFKFB2O60825 505 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2IP78347 998 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 FANCBQ8NB91 859 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 STAMQ92783 540 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 CARD6Q9BX69 1037 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 ATP5DP30049 168 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms