RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.8■■□□□ 1.72
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HOXD1-201ENST00000331462 NR5A1Q13285 461 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 PARP10Q53GL7 1025 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.8■■□□□ 1.72
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HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.75■■□□□ 1.71
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HOXD1-201ENST00000331462 MNS1Q8NEH6 495 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 URI1O94763 535 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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