RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRF1Q92994 677 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR90Q96KV7 1748 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCN4AP35499 1836 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 SULF1Q8IWU6 871 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKX2-3Q8TAU0 364 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOOK2Q96ED9 719 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHMT1P34896 483 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC178Q5BJE1 867 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXL16Q8N461 479 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC17Q96LX7 622 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM196BA6NMK8 535 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 POTECB2RU33 542 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 WTAPQ15007 396 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFXL1Q6ZNB6 911 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGXT2Q9BYV1 514 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D12O60347 775 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMTC2Q8N394 836 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEPSINQ96N21 525 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJC18Q9H819 358 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGAP2Q9UHJ9 254 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNKSO95271 1327 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDAN1Q8IWY9 1227 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEDD1Q8NHV4 660 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRAGCQ9HB90 399 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIFRP42702 1097 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TATDN1Q6P1N9 297 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIGA2Q7L4E1 593 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC11AQ9Y240 323 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC69A6NI79 296 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLURP2P0DP57 97 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOBRQ0VD83 1088 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCAF15Q66K64 600 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT26Q7Z3Y9 468 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMX3Q96JJ7 454 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 LY9Q9HBG7 655 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPCN1Q9ULQ1 816 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKR1B1P15121 316 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 CABP5Q9NP86 173 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIPA1L1O43166 1804 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 NMT2O60551 498 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCB5Q2M3G0 1257 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC4A3P48751 1232 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP3K10Q02779 954 aa32.16■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGMS1Q86VZ5 419 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGKHQ86XP1 1220 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC12A7Q9Y666 1083 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLIN4Q96Q06 1357 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ME3Q16798 604 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM179Q6ZVK1 233 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP48Q86UV5 1035 aa32.15■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GDF11O95390 407 aa32.14■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 STK3Q13188 491 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC37L1Q7L3B6 337 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF341Q9BYN7 854 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYH8P13535 1937 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA8BA8MQT2 603 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 CATIPQ7Z7H3 387 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHMP4CQ96CF2 233 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP95Q96GE4 821 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 KAT14Q9H8E8 782 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 SENP2Q9HC62 589 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRPF3Q9ULD4 1205 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB43O43298 467 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 LARGE1O95461 756 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 NF2P35240 595 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOA5Q6Q788 366 aa32.11■■■□□ 2.73
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