RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 CYP21A2P08686 494 aa15.72■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.72■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 NECTIN1Q15223 517 aa15.72■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 C8orf34Q49A92 452 aa15.72■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D10CQ8IV04 446 aa15.72■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC17Q96LX7 622 aa15.72■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.72■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 RASA1P20936 1047 aa15.71■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 NT5C2P49902 561 aa15.71■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.71■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.71■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 RASAL3Q86YV0 1011 aa15.71■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.71■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.71■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.71■□□□□ 0.11
CCDC42-201ENST00000293845 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 GDF11O95390 407 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 SLC10A3P09131 477 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 PTPRAP18433 802 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 JAG1P78504 1218 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 HTRA3P83110 453 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 ERO1BQ86YB8 467 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC102AQ96A19 550 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 ELP3Q9H9T3 547 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 PICK1Q9NRD5 415 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 MYH4Q9Y623 1939 aa15.7■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 PRDM1O75626 825 aa15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 GH2P01242 217 aa15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 AKR1B1P15121 316 aa15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 PPATQ06203 517 aa15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 WNK4Q96J92 1243 aa15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D2Q9BYX2 928 aa15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 CABP5Q9NP86 173 aa15.69■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 SLC27A2O14975 620 aa15.68■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 GUCY1A2P33402 732 aa15.68■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 HSPA4P34932 840 aa15.68■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 ECE1P42892 770 aa15.68■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 PPIL2Q13356 520 aa15.68■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 SPRYD7Q5W111 196 aa15.68■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.68■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 OPTNQ96CV9 577 aa15.68■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 INCENPQ9NQS7 918 aa15.68■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 NEDD4P46934 1319 aa15.68■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 USP17L5A8MUK1 530 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 GJA5P36382 358 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 RNF20Q5VTR2 975 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 KCNB2Q92953 911 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 CAPNS2Q96L46 248 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 USP26Q9BXU7 913 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 LOC285556D6RIA3 1793 aa15.67■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 SEPT2Q15019 361 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 ESR2Q92731 530 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 OTUD5Q96G74 571 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 WDR18Q9BV38 432 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 KRT23Q9C075 422 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 AS3MTQ9HBK9 375 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 ZHX2Q9Y6X8 837 aa15.66■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 TSPY2A6NKD2 308 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 E7EWF7 191 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 IRF6O14896 467 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 TSPY3P0CV98 308 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 TSPY8P0CW00 308 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 TFAP4Q01664 338 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 NOGQ13253 232 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 TOMM22Q9NS69 142 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC42-201ENST00000293845 CXCL11O14625 94 aa15.64■□□□□ 0.09
CCDC42-201ENST00000293845 SEC24BO95487 1268 aa15.64■□□□□ 0.09
CCDC42-201ENST00000293845 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CCDC42-201ENST00000293845 VEGFBP49765 207 aa15.64■□□□□ 0.09
CCDC42-201ENST00000293845 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms