RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 MAP2K5Q13163 448 aa12.91□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 RASGRF1Q13972 1273 aa12.91□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 CCL14Q16627 93 aa12.91□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 MFSD14CQ5VZR4 134 aa12.91□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 SIL1Q9H173 461 aa12.91□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 PI4KBQ9UBF8 816 aa12.91□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 SIPA1L1O43166 1804 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 TMEM265A0A087WTH1 108 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 USP17L10C9JJH3 530 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 FOSL2P15408 326 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 RTP1P59025 263 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 CCNA1P78396 465 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 MECOMQ03112 1051 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 SHHQ15465 462 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 Q3C1V9 767 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 MYLIPQ8WY64 445 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 PORCNQ9H237 461 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 HDAC5Q9UQL6 1122 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 TTC28Q96AY4 2481 aa12.9□□□□□ -0.34
USP41-201ENST00000292729 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa12.89□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 COL9A1P20849 921 aa12.89□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 FOCADQ5VW36 1801 aa12.89□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 DNAH12Q6ZR08 3092 aa12.89□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 TNFRSF10AO00220 468 aa12.88□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 ADORA1P30542 326 aa12.88□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 TJAP1Q5JTD0 557 aa12.88□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 ARRDC4Q8NCT1 418 aa12.88□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 PAGR1Q9BTK6 254 aa12.88□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 AKAP2Q9Y2D5 859 aa12.88□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa12.88□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 SLC15A5A6NIM6 579 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 PEX10O60683 326 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 HOXC6P09630 235 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 CNGA1P29973 690 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 ATP2B2Q01814 1243 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 C9orf50Q5SZB4 431 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L2Q6R6M4 530 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 TEX11Q8IYF3 940 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 ZNF384Q8TF68 577 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 COPRSQ9NQ92 184 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 CDH23Q9H251 3354 aa12.87□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 PTPREP23469 700 aa12.86□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 TIMM10P62072 90 aa12.86□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa12.86□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 XAGE2Q96GT9 111 aa12.86□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 TRIM34Q9BYJ4 488 aa12.86□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 FLRT1Q9NZU1 646 aa12.86□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa12.86□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 A0A1B0GUL7 405 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 KBTBD13C9JR72 458 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 BAG3O95817 575 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 PLCG2P16885 1265 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 SNX17Q15036 470 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 C1orf53Q5VUE5 145 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 BADQ92934 168 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 C12orf42Q96LP6 360 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 MRS2Q9HD23 443 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 ZNF236Q9UL36 1845 aa12.85□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L15C9J2P7 530 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L13C9JLJ4 530 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L11C9JVI0 530 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L18D6R9N7 530 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L22D6RA61 530 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L17D6RBQ6 530 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L19D6RCP7 530 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L20D6RJB6 530 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L24Q0WX57 530 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 GRB14Q14449 540 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 WDR78Q5VTH9 848 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 POTEEQ6S8J3 1075 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 LBX2Q6XYB7 198 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 SPATA5Q8NB90 893 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 EMILIN3Q9NT22 766 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 RAI14Q9P0K7 980 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 HMG20BQ9P0W2 317 aa12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 MUC3AQ02505 3323 aa12.83□□□□□ -0.35
USP41-201ENST00000292729 CNMDO75829 334 aa12.83□□□□□ -0.36
USP41-201ENST00000292729 IGHA2P01877 340 aa12.83□□□□□ -0.36
USP41-201ENST00000292729 CYBAP13498 195 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms