RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 NUP98P52948 1817 aa28.85■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.85■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.85■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 RAI14Q9P0K7 980 aa28.85■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 DOCK2Q92608 1830 aa28.84■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.84■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 KIFC2Q96AC6 838 aa28.84■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa28.84■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 TEX35Q5T0J7 233 aa28.83■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 TRIML1Q8N9V2 468 aa28.83■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 MED15Q96RN5 788 aa28.83■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.83■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 DESI2Q9BSY9 194 aa28.83■■■□□ 2.21
CTBP1-201ENST00000290921 SNAP23O00161 211 aa28.82■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 PRKAB2O43741 272 aa28.82■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 NR1I3Q14994 352 aa28.82■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 RTN1Q16799 776 aa28.82■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC82Q8N4S0 544 aa28.82■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 AK7Q96M32 723 aa28.82■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 SLIT2O94813 1529 aa28.82■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 TBC1D8O95759 1140 aa28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 NR5A1Q13285 461 aa28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 TDO2P48775 406 aa28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 PLCD1P51178 756 aa28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 WTAPQ15007 396 aa28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 SART3Q15020 963 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 KARSQ15046 597 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 KANK3Q6NY19 840 aa28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 LCORLQ8N3X6 602 aa28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 SASH3O75995 380 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 GNAT2P19087 354 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 DHX58Q96C10 678 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 UBXN6Q9BZV1 441 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 ATP2B1P20020 1258 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 TOMM22Q9NS69 142 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.8■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 DEXIO95424 95 aa28.79■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 MTF1Q14872 753 aa28.79■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 USP49Q70CQ1 688 aa28.79■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.79■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 A0A1B0GTH6 734 aa28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 RABGGTAQ92696 567 aa28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 PARD6BQ9BYG5 372 aa28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 CSRNP2Q9H175 543 aa28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 SPATA20Q8TB22 786 aa28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 BTG4Q9NY30 223 aa28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 DISP2A7MBM2 1401 aa28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 OXER1Q8TDS5 423 aa28.77■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 GOLGA1Q92805 767 aa28.77■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 MTA3Q9BTC8 594 aa28.77■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 ERICH2A1L162 156 aa28.77■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC175P0C221 793 aa28.77■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 PANX2Q96RD6 677 aa28.77■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 ARFGAP3Q9NP61 516 aa28.77■■■□□ 2.2
CTBP1-201ENST00000290921 SUSD4Q5VX71 490 aa28.76■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 CABP5Q9NP86 173 aa28.76■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.76■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 SOWAHDA6NJG2 315 aa28.76■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 TEX33O43247 280 aa28.76■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 RCAN1P53805 252 aa28.76■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 BCAMP50895 628 aa28.75■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 TMTC2Q8N394 836 aa28.75■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.75■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 OAS2P29728 719 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 BCORQ6W2J9 1755 aa28.74■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF654Q8IZM8 581 aa28.74■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 NUP133Q8WUM0 1156 aa28.74■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC34Q96HJ3 373 aa28.74■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 PPFIBP1Q86W92 1011 aa28.73■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 MIGA1Q8NAN2 632 aa28.73■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 FANCBQ8NB91 859 aa28.73■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CTBP1-201ENST00000290921 LZTFL1Q9NQ48 299 aa28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.2 ms