RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
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ANKRD40-201ENST00000285243 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.63■■□□□ 1.05
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ANKRD40-201ENST00000285243 SLC1A4P43007 532 aa21.63■■□□□ 1.05
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ANKRD40-201ENST00000285243 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.053e-6■□□□□ 11.3
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ANKRD40-201ENST00000285243 CRB1P82279 1406 aa21.62■■□□□ 1.05
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ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.61■■□□□ 1.05
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ANKRD40-201ENST00000285243 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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ANKRD40-201ENST00000285243 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.59■■□□□ 1.05
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ANKRD40-201ENST00000285243 PAF1Q8N7H5 531 aa21.58■■□□□ 1.05
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ANKRD40-201ENST00000285243 BICD1Q96G01 975 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.57■■□□□ 1.04
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ANKRD40-201ENST00000285243 NR5A1Q13285 461 aa21.57■■□□□ 1.04
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