RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283882.3

CFDP1-201, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFDP1, Length 1,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-201ENST00000283882 SEC23AQ15436 765 aa14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 CHST3Q7LGC8 479 aa14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 FAM151AQ8WW52 585 aa14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 ANKS1AQ92625 1134 aa14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 INCENPQ9NQS7 918 aa14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 RNF181Q9P0P0 153 aa14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 TNKSO95271 1327 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 TSPY2A6NKD2 308 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 WNT10BO00744 389 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 TNFAIP1Q13829 316 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 APOA5Q6Q788 366 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 MICALL2Q8IY33 904 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.66□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 CNTNAP1P78357 1384 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 H7C1D1 291 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 PRDM1O75626 825 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 NOVP48745 357 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 PPP2R5BQ15173 497 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 DGKHQ86XP1 1220 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 CCDC17Q96LX7 622 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.65□□□□□ -0.06
CFDP1-201ENST00000283882 MYH8P13535 1937 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 CCDC69A6NI79 296 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 DDAH1O94760 285 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 TSPY3P0CV98 308 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 TSPY8P0CW00 308 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 TNNI2P48788 182 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 CACNB3P54284 484 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 NUCB2P80303 420 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 SCRN1Q12765 414 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.64□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 ZBTB43O43298 467 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 CALM1P0DP23 149 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 CALM2P0DP24 149 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 CALM3P0DP25 149 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 SHMT1P34896 483 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 CLCN6P51797 869 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 TFAP4Q01664 338 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 GPR162Q16538 588 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 NECAB1Q8N987 351 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 KIF3AQ9Y496 699 aa14.63□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 CLRN2A0PK11 232 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 TBC1D12O60347 775 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 CDKL5O76039 1030 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 PDCP20941 246 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 TCP10Q12799 353 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 RGS22Q8NE09 1264 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 MAP3K14Q99558 947 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 DNAJC18Q9H819 358 aa14.62□□□□□ -0.07
CFDP1-201ENST00000283882 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms