RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC10P48553 1259 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 KRT83P78385 493 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 CCDC144BQ3MJ40 725 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 BRINP3Q76B58 766 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 CTAGE6Q86UF2 777 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 CTAGE4Q8IX94 777 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 IGSF22Q8N9C0 903 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 TSC1Q92574 1164 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 NLRP3Q96P20 1036 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 MYL10Q9BUA6 226 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 DEF6Q9H4E7 631 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 SPATA1Q5VX52 437 aa10.02□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 CYP26C1Q6V0L0 522 aa10.02□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
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HERC3-201ENST00000264345 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.02□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.02□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 KCNJ14Q9UNX9 436 aa10.02□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa10.02□□□□□ -0.8
HERC3-201ENST00000264345 EPS15P42566 896 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 UBE4AQ14139 1066 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PIGBQ92521 554 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D10CQ8IV04 446 aa10.02□□□□□ -0.81
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HERC3-201ENST00000264345 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 FANCLQ9NW38 375 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 BICDL1Q6ZP65 573 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 EXOC1Q9NV70 894 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 BTBD18B2RXH4 712 aa10.01□□□□□ -0.81
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HERC3-201ENST00000264345 GALNT17Q6IS24 598 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 TRIM47Q96LD4 638 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CLIC6Q96NY7 704 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 LY9Q9HBG7 655 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SALL1Q9NSC2 1324 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PAK1Q13153 545 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 DTHD1Q6ZMT9 781 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CYB5R4Q7L1T6 521 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 MAN1B1Q9UKM7 699 aa10.01□□□□□ -0.81
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HERC3-201ENST00000264345 C6orf50Q9HD87 102 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 TUBE1Q9UJT0 475 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PTPREP23469 700 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CCDC181Q5TID7 509 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 NUP58Q9BVL2 599 aa10.01□□□□□ -0.81
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HERC3-201ENST00000264345 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CTNND2Q9UQB3 1225 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 VWA3AA6NCI4 1184 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PLCG2P16885 1265 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CCZ1BP86790 482 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SETDB2Q96T68 719 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 KCND1Q9NSA2 647 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ZSWIM5Q9P217 1185 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 MTMR7Q9Y216 660 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 AP5Z1O43299 807 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 GNA11P29992 359 aa10□□□□□ -0.81
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HERC3-201ENST00000264345 ANTXR2P58335 489 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 BRD3Q15059 726 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PANX2Q96RD6 677 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CARD6Q9BX69 1037 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 TSGA10Q9BZW7 698 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10□□□□□ -0.81
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HERC3-201ENST00000264345 KIF28PB7ZC32 967 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CHRNDQ07001 517 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PI16Q6UXB8 463 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 MAGEF1Q9HAY2 307 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SLFN14P0C7P3 912 aa9.99□□□□□ -0.81
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