RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 WTAPQ15007 396 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 IFFO2Q5TF58 517 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 C12orf60Q5U649 245 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 OXER1Q8TDS5 423 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 UBAC1Q9BSL1 405 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 MRIQ9BWK5 157 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 INCENPQ9NQS7 918 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.15□□□□□ -0.62
APOBEC1-201ENST00000229304 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.15□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ROBO3Q96MS0 1386 aa11.15□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC69A6NI79 296 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 BTDP43251 543 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 RHBDL3P58872 404 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 GTF2IP78347 998 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 PDE4BQ07343 736 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 RESTQ13127 1097 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 SEC23AQ15436 765 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ATL3Q6DD88 541 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 USP48Q86UV5 1035 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 DDX11Q96FC9 970 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 TOMM22Q9NS69 142 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 SNED1Q8TER0 1413 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ELP1O95163 1332 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 STK36Q9NRP7 1315 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 FSD2A1L4K1 749 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA8AA7E2F4 631 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CHRNA5P30532 468 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 USP5P45974 858 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT85P78386 507 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 NTRK3Q16288 839 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 OLFM4Q6UX06 510 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 NFXL1Q6ZNB6 911 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 IQCA1Q86XH1 822 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 GPT2Q8TD30 523 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKS1AQ92625 1134 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 SENP2Q9HC62 589 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 LAMA4Q16363 1823 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 TNKSO95271 1327 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 TK2O00142 265 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 IFNAR1P17181 557 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CDC27P30260 824 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 UBE2HP62256 183 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 VPS33BQ9H267 617 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CNPY2Q9Y2B0 182 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM22K7EJ46 135 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 DTNBO60941 627 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 DDAH1O94760 285 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 USP17L8P0C7I0 530 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CALM1P0DP23 149 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CALM2P0DP24 149 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CALM3P0DP25 149 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP2D6P10635 497 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF445P59923 1031 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA2012Q0VF49 1180 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 RTN1Q16799 776 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 MICU3Q86XE3 530 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 TEX11Q8IYF3 940 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF654Q8IZM8 581 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 CERS5Q8N5B7 392 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 TTLL6Q8N841 843 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 WASF1Q92558 559 aa11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
APOBEC1-201ENST00000229304 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms