RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gas1Q01721 343 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spg7Q3ULF4 781 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ift122Q6NWV3 1182 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1700018B08RikQ9DA83 213 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lekr1B2RVN1 116 aa20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp26c1B2RXA7 518 aa20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LtkP08923 888 aa20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trappc10Q3TLI0 1259 aa20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrd1Q8C0R9 853 aa20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ubac1Q8VDI7 409 aa20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Iqca1Q9CUL5 857 aa20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abl1P00520 1123 aa20.7■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif22Q3V300 660 aa20.7■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adck5Q80V03 582 aa20.7■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tubgcp2Q921G8 905 aa20.7■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dydc2Q9D3X8 139 aa20.7■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dync1i1O88485 628 aa20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mns1Q61884 491 aa20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PnnO35691 725 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppfibp2O35711 882 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Asnsd1Q8BFS9 627 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ctdspl2Q8BG15 465 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igsf9bE9PZ19 1328 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phldb3E9QAF4 648 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep128Q8BI22 1102 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc14a2Q8R4T9 930 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Brms1Q99N20 246 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdc27A2A6Q5 825 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pet2A2AHY8 747 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Frat1P70339 274 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LrmpQ60664 539 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HlfQ8BW74 295 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pfkfb3A7UAK5 555 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnm3Q8BZ98 863 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gimap7Q8R379 293 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tgs1Q923W1 853 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NsmfQ99NF2 532 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GdaQ9R111 454 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CluhQ5SW19 1315 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A0A1Y7VML8 143 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10134F6ZQC6 126 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sdc2P43407 202 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pex1Q5BL07 1284 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arid3aQ62431 601 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RadxQ8C779 850 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slfn1Q9Z0I7 337 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prss40A6H6T1 365 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Api5O35841 504 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tpm1P58771 284 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ap5z1Q3U829 807 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Triml1Q8BVP1 470 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim29Q8R2Q0 587 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cbx6Q9DBY5 414 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Epb41l3Q9WV92 929 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Scg2Q03517 617 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam83bQ0VBM2 1012 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tbx2Q60707 711 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hdac4Q6NZM9 1076 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klhl30Q8C3F7 581 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mtmr6Q8VE11 617 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vps33aQ9D2N9 598 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgap33Q80YF9 1305 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nek1P51954 1203 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rasa2P58069 847 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp4cP97470 307 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbm12b2Q66JV4 834 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Usp49Q6P9L4 685 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp397Q7TNK4 527 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem179Q8BHH9 233 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 DlatQ8BMF4 642 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Taok3Q8BYC6 898 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankk1Q8BZ25 745 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vps16Q920Q4 839 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AllcQ9JHX6 414 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MarcksP26645 309 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdcp1Q5U462 833 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep85Q8BMK0 761 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrit1Q8K099 624 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tktl2Q9D4D4 627 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpaa1Q9WTK3 621 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Magi2Q9WVQ1 1275 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ano3A2AHL1 981 aa20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.4 ms