RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049272.4

Hoxb5-201, Transcript of Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxb5, Length 1,895 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Rnf123Q5XPI3 1314 aa18.41■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Lipo1J3QME6 396 aa18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Mmp10O55123 476 aa18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Nmt2O70311 529 aa18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Slain1Q68FF7 579 aa18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Sgsm2Q80U12 1005 aa18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 QarsQ8BML9 775 aa18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Fam83aQ8K2P2 436 aa18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Clip2Q9Z0H8 1047 aa18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Col2a1P28481 1487 aa18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Sept2P42208 361 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Clstn1Q9EPL2 979 aa18.39■□□□□ 0.54
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Prdm1Q60636 856 aa18.39■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa18.39■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Atad2Q8CDM1 1040 aa18.39■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Med23Q80YQ2 1367 aa18.39■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Zkscan16A2ALW2 728 aa18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Serpinb2P12388 415 aa18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ftl1P29391 183 aa18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 OsbpQ3B7Z2 805 aa18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Rasa3Q60790 834 aa18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Cnksr2Q80YA9 1032 aa18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Calhm4Q8CE93 315 aa18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Odf2lQ9D478 642 aa18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Dock5B2RY04 1868 aa18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Zscan18E9PUD6 809 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gm29094F6Q785 221 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Pald1P70261 859 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 PcQ05920 1178 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Prr7Q3V0I2 269 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Garem2Q6PAJ3 880 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Slc44a1Q6X893 653 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Il31raQ8K5B1 716 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Tceanc2Q8R2M0 207 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Cdca7lQ922M5 438 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Zmym2Q9CU65 1376 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Cyp2d34L7N463 504 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Cbx2P30658 519 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Otud5Q3U2S4 566 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Eme2Q56A04 373 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Zbtb39Q6PDK0 712 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Tacc1Q6Y685 774 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Scfd2Q8BTY8 684 aa18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Sema3fO88632 785 aa18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ptpn12P35831 775 aa18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Anapc15P60007 132 aa18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Pxylp1Q8BHA9 480 aa18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 DlatQ8BMF4 642 aa18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Fsd2Q8BZ52 692 aa18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 OplahQ8K010 1288 aa18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Frmpd4A2AFR3 1320 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Kcnb2A6H8H5 907 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 ErmnQ5EBJ4 281 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Myl10Q62082 202 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Col11a1Q61245 1804 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Cfap99A0A140LIX9 648 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Has3O08650 554 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 PtpraP18052 829 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Sv2cQ69ZS6 727 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gm21985Q6P6P5 1106 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Cep55Q8BT07 462 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Vmn1r199Q8R280 367 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ero1bQ8R2E9 467 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Mtmr4Q91XS1 1190 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Eid1Q9DCR4 169 aa18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Glra4Q61603 456 aa18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Sp8Q8BMJ8 486 aa18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Lca5lQ8C0X0 741 aa18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Rfc4Q99J62 364 aa18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Dicer1Q8R418 1916 aa18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Armc3A2AU72 881 aa18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Usp17ldG5E8G2 545 aa18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Usp17lcG5E8I7 545 aa18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 ThbdP15306 577 aa18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 TbcaP48428 108 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Atoh1P48985 351 aa18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Traf5P70191 558 aa18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gjb2Q00977 226 aa18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Zfp341Q6PGC9 846 aa18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 SynrgQ5SV85 1306 aa18.33■□□□□ 0.52
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Prr16A3KMN5 304 aa18.33■□□□□ 0.52
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Phactr2B1AVP0 632 aa18.33■□□□□ 0.52
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gm44503E9PYU5 387 aa18.33■□□□□ 0.52
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Oog1E9Q5G7 496 aa18.33■□□□□ 0.52
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa18.33■□□□□ 0.52
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Myl3P09542 204 aa18.33■□□□□ 0.52
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 F2rP30558 430 aa18.33■□□□□ 0.52
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Usp5P56399 858 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Usp50Q6P8X6 390 aa18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.6 ms