RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018842.13

Lhx1-201, Transcript of LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lhx1, Length 3,846 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Msl1Q6PDM1 616 aa16.05■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Dnaaf4Q8R368 420 aa16.05■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Ift122Q6NWV3 1182 aa16.05■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Znf18Q810A1 556 aa16.05■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 PparaP23204 468 aa16.04■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Tpm2P58774 284 aa16.04■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Scg2Q03517 617 aa16.04■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 1700013D24RikQ0P521 120 aa16.04■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Ces1aE9PYP1 563 aa16.04■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 SsbP32067 415 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Pcdhb5Q91XZ5 792 aa16.04■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Nmt2O70311 529 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Slurp2P0DP59 97 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 MarcksP26645 309 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Usp5P56399 858 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Xrcc4Q924T3 326 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 EvplQ9D952 2035 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 NcapgE9PWG6 1004 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 DnttP09838 530 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 VrtnQ3SYK4 740 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Glis3Q6XP49 780 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Vps16Q920Q4 839 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Dynll2Q9D0M5 89 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 1700018B08RikQ9DA83 213 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Gpaa1Q9WTK3 621 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Dok7Q18PE0 504 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Cyp7b1Q60991 507 aa16.03■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Kifc2O08672 792 aa16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Rpusd2Q149F1 553 aa16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Zkscan4Q5SZT6 480 aa16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 WaslQ91YD9 501 aa16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 BccipQ9CWI3 316 aa16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 DSCC1Q14AI0 399 aa16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 NenfQ9CQ45 171 aa16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Calml3Q9D6P8 149 aa16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Phrf1A6H619 1682 aa16.02■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 1810065E05RikQ5NC41 235 aa16.02■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Haus7Q8BKT8 364 aa16.02■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 FAM186AQ9D9R9 1790 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Kcnk13Q8R1P5 405 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 CpzQ8R4V4 654 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Fam186bD3Z420 943 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Ftl1P29391 183 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Pramel6Q810Y9 485 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Zfp91Q62511 572 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Tas2r124Q7M718 309 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Vps53Q8CCB4 832 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Lzts2Q91YU6 671 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Sel1lQ9Z2G6 790 aa16.01■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Usp53P15975 1069 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Eya3P97480 510 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Best3Q6H1V1 669 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Lrrd1Q8C0R9 853 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Vmn2r68L7N2B3 851 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Fam89aQ14BJ1 175 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Cyp4x1Q6A152 507 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Tsen34Q8BMZ5 316 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Ndufv1Q91YT0 464 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Brms1Q99N20 246 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Etnk1Q9D4V0 363 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Ano6Q6P9J9 911 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Lonrf3Q9D4H7 753 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Tob2Q9JM55 345 aa16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Pfkfb3A7UAK5 555 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Zscan18E9PUD6 809 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Trappc10Q3TLI0 1259 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Arhgef16Q3U5C8 713 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Pex1Q5BL07 1284 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Adam7O35227 789 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Slc44a4Q91VA1 707 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Cnpy2Q9QXT0 182 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Sdc2P43407 202 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 EgfrQ01279 1210 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Fam178bQ24JP3 464 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Ankrd13aQ80UP5 588 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa15.99■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 A0A0U1RNP2 1173 aa15.98■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Cdkn1cP49919 348 aa15.98■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Usp50Q6P8X6 390 aa15.98■□□□□ 0.15
Lhx1-201ENSMUST00000018842 Gys2Q8VCB3 704 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.4 ms