RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	NRAP	Q86VF7	1730 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	EVC	P57679	992 aa		11.27	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.27	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.27	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.27	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RAD21	O60216	631 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	KIF5B	P33176	963 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	YEATS4	O95619	227 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CYP2D6	P10635	497 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PLCG2	P16885	1265 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	STX1A	Q16623	288 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	IFNAR1	P17181	557 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	GTF2I	P78347	998 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PICALM	Q13492	652 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CTR9	Q6PD62	1173 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	MYH3	P11055	1940 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	NLRP5	P59047	1200 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TFAP4	Q01664	338 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	BIN1	O00499	593 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	BTD	P43251	543 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	SYK	P43405	635 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PPP2R5B	Q15173	497 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ATP2B2	Q01814	1243 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ADAL	Q6DHV7	355 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	BTBD18	B2RXH4	712 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	MMP10	P09238	476 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RXRB	P28702	533 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PDE6B	P35913	854 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CAVIN2	O95810	425 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	KRT2	P35908	639 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TM4SF1	P30408	202 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CNNM3	Q8NE01	707 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	NMT2	O60551	498 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PDILT	Q8N807	584 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	EYA3	Q99504	573 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TCHH	Q07283	1943 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TRIM75P	A6NK02	468 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	DDAH1	O94760	285 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	NDUFA8	P51970	172 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.22	□□□□□ -0.61

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