RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SCARB2-222	ENST00000640634	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SCARB2-222	ENST00000640634	ENTPD3	O75355	529 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SCARB2-222	ENST00000640634	PLCG2	P16885	1265 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SCARB2-222	ENST00000640634	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SCARB2-222	ENST00000640634	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SCARB2-222	ENST00000640634	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SCARB2-222	ENST00000640634	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SCARB2-222	ENST00000640634	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	MYH1	P12882	1939 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	HSPA6	P17066	643 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	CHML	P26374	656 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	PLCD1	P51178	756 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	INPP5B	P32019	993 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	HUNK	P57058	714 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	USP17L21	D6R901	530 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	APP	P05067	770 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	NF2	P35240	595 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	JAG1	P78504	1218 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	GRM1	Q13255	1194 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	LAMB1	P07942	1786 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	TDO2	P48775	406 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	VGLL4	Q14135	290 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCARB2-222	ENST00000640634	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	PTH1R	Q03431	593 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	HIP1	O00291	1037 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	SGSM2	O43147	1006 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	GDF11	O95390	407 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	TRAK2	O60296	914 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	CDC45	O75419	566 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	FGA	P02671	866 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SCARB2-222	ENST00000640634	GNAT2	P19087	354 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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