RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 TM4SF1P30408 202 aa21.41■■□□□ 1.02
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CLN8-211ENST00000636934 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 TIGD1Q96MW7 591 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 SBF2Q86WG5 1849 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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CLN8-211ENST00000636934 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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CLN8-211ENST00000636934 TRIM5Q9C035 493 aa21.41■■□□□ 1.02
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CLN8-211ENST00000636934 ZNF75DP51815 510 aa21.4■■□□□ 1.02
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CLN8-211ENST00000636934 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.4■■□□□ 1.02
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CLN8-211ENST00000636934 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.39■■□□□ 1.01
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CLN8-211ENST00000636934 ZNF202O95125 648 aa21.38■■□□□ 1.01
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CLN8-211ENST00000636934 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.38■■□□□ 1.01
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CLN8-211ENST00000636934 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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CLN8-211ENST00000636934 USP17L21D6R901 530 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-211ENST00000636934 SYKP43405 635 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-211ENST00000636934 SPC24Q8NBT2 197 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-211ENST00000636934 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.36■■□□□ 1.01
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CLN8-211ENST00000636934 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.36■■□□□ 1.01
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CLN8-211ENST00000636934 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
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CLN8-211ENST00000636934 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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CLN8-211ENST00000636934 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.36■■□□□ 1.01
CLN8-211ENST00000636934 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
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CLN8-211ENST00000636934 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN8-211ENST00000636934 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN8-211ENST00000636934 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CLN8-211ENST00000636934 HPSEQ9Y251 543 aa21.35■■□□□ 1.01
CLN8-211ENST00000636934 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CLN8-211ENST00000636934 GUCY1A2P33402 732 aa21.34■■□□□ 1.01
CLN8-211ENST00000636934 NLRP12P59046 1061 aa21.34■■□□□ 1.01
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